1.颜色不同

青柠檬是柠檬家族中一个独立的品种，从挂果一直到成熟，表皮都是青色的比较光滑；黄柠檬是刚刚挂果时是青色的，表皮上有比较细致的纹理，成熟后外皮则变成金黄色，果肉也呈浅金黄色。

2.味道不同

青柠檬的香味比较浅淡，国产青柠成熟后的果肉酸味也不重，而且回味稍带有苦涩感。黄柠檬的香味比较浓郁，口感酸、薄，适应那种酸味之后，其实当作水果慢慢品尝也可以接受。

3.产地不同

在国内产的柠檬多为黄柠檬，特别是北方几乎都是黄柠檬，青柠檬在海南和云南一带有产，东南亚由于美食风俗的原因目前种植几乎的都是青柠檬，可能是因为地理的原因吧，欧洲种植的几乎也都是黄柠檬。

4.用途不同

青柠檬的果汁比黄柠檬要多一些，皮也比黄柠檬要薄一些，最适合榨汁饮用或制作成酸味浓郁的果汁类饮料。青柠檬在泰菜或东南亚菜还常被当作调料使用，与鱼类一起烹煮可以去腥味，与肉类一起烹煮能让肉质松软鲜美。 黄柠檬在烹调中多用于西餐，通常也是榨成柠檬汁或切成柠檬片泡水饮用，用来搭配海鲜能起到去腥、吊鲜和增香的作用。

5.营养成分不同

青柠檬和黄柠檬虽然有很大的区别，但是就营养成分而言，二者非常的接近，可以说基本相同，只是青柠檬中的柠檬酸和维生素C含量稍高。