1.外观不同

杏仁表面光滑的，而边缘有沟纹，而且外壳为坚硬木质。巴旦木而扁桃核有明显蜂巢状孔纹，形状是圆锥形，而其仁皮为黄色，种子个子比较大。

2.种类不同

巴旦木又名扁桃仁，是桃属中扁桃亚属的植物，就是扁桃的内核，主要产自美国地区，在亚洲地区也有分布，但是种植面积不多，它的营养极为丰富。而杏仁属于蔷薇科植物，是杏的种子，二者有天壤之别。

3.味道营养不同

杏仁有丰富的营养物质，味道上有苦杏仁，也有甜杏仁，也可以作药，有小毒，而巴旦木是一种重要的油料材料，味道很香，有很好的助消化的能力。也有很高的营养价值。

4.功效不同

巴旦木营养丰富，在同质量的情况下，它的营养价值比牛肉高5-6倍，有安神、润肠、健身、健胃的功效，在晚上睡觉前，吃个十几粒，通常会睡熟无梦，还能增加身体抵抗力。它还能适宜孕妇食用，对胎儿的发育既有好处，还能美容养颜、促进泌乳。而杏仁可分为甜杏仁及苦杏仁，营养价值也极高，甜杏仁能直接食用，而苦杏仁多入药，有抗氧化、防早衰的功效，但是不宜多食，以免中毒，而且不适宜孕妇食用，以免滑胎。

5.口感不同

巴旦木有一股特殊的甜香味，吃起来脆甜。而杏仁气味虽然芳香，但是有一股苦味，如果不经过处理味道是苦味的，所以很多时候会经过处理，表面会有一层盐分，有咸味。